Маркелов Денис Анатольевич

MarkelovDA

Профессор, доктор физико-математических наук

 

Электронный адрес: Адрес электронной почты защищен от спам-ботов. Для просмотра адреса в вашем браузере должен быть включен Javascript.Адрес электронной почты защищен от спам-ботов. Для просмотра адреса в вашем браузере должен быть включен Javascript.

Адрес: НИИФ, корпус И, к. 341

Курсы:

 

Группа профессора

Маркелова Дениса Анатольевича

Title Markelov

 

Основные направления исследований

Теоретические и экспериментальные исследования дендримеров

Дендримеры – это макромолекулы, характеризующиеся регулярным древовидным ветвлением. Дендримерные макромолекулы имеют компактную сферическую форму и наноразмеры. Благодаря своей древовидной структуре (топологии) дендримеры обладают большим количеством концевых групп, которые можно модифицировать в процессе синтеза придавая всей макромолекуле необходимые свойства. Эти и другие уникальные особенности дендримеров делают их востребованными в различных практических приложениях (в химии, биологии, медицине и т.д), начиная с их использования в качестве нанореакторов для синтеза монодисперсных металлических наночастиц до доставки лекарственных средств или магниторезонансных меток в клетки организма. По дендримерной тематике публикуется более 500 научных статей индексируемых в WOS и Scopus.

 Figure1
 Рисунок. Принципиальная схема доставки лекарственных веществ с помощью дендримерного наноконтейнера.

 

 Figure2
Рисунок. Синтез металических наночастиц с помощью дендримеров.

Уникальностью нашей группы является использование комплексного подхода для изучения дендримеров, включающего в себя построение/развитие аналитических теорий, молекулярно-динамическое моделирование и экспериментальные исследования (ЯМР спектроскопия и релаксация, малоугловое рентгеновское рассеивание, цитологические исследования). Такой подход позволяет всесторонне исследовать дендримерные структуры и детально описывать и объяснять особенности древовидных макромолекул. Учитывая непростую историю исследования дендримеров, в которой неправильные представления о структурных свойствах были трендом в течение десятилетий (например, см недавний обзор о формировании полости внутри дендримеров D.A. Markelov, et. al // Macromol. Chem. Phys., 2021, 222, 2100085), именно всесторонний подход позволяет достоверно объяснять и описывать эффекты, наблюдаемые для дендримерных систем.

Все исследовательские работы группы выполняются на мировом уровне, внося важный вклад в развитие фундаментальных представлений о дендримерах, а также развитие технологий на основе дендримеров.

 

Последние публикации по дендримерам:

Развитие теории ориентационной подвижности в дендримерах, проявляющей в различных экспериментах и ее экспериментальное подтверждение:

  • N.N. Sheveleva, D.A. Markelov, M.A. Vovk, M. E. Mikhailova, I.I. Tarasenko, I. M. Neelov, E. Lähderanta / NMR studies of excluded volume interactions in peptide dendrimers // Scientific Reports, 2018, V. 8, No. 8916.
    https://www.nature.com/articles/s41598-018-27063-3

Экспериментальные и теоретические исследования расплавов карбосилановых дендримеров:

  • V.V. Matveev, D. A. Markelov, S.V. Dvinskikh, A. N. Shishkin, K.V. Tyutyukin, A.V. Penkova, E.A. Tatarinova, G.M. Ignat'eva, S.A. Milenin / Investigation of Melts of Polybutylcarbosilane Dendrimers by 1H NMR Spectroscopy // Scientific Reports, 2017, V. 7, No. 13710.

Развитие теории о формировании полости внутри дендримера

  • D.А. Markelov, A. A. Polotsky, T. M. Birshtein / Formation of a “hollow” interior in the fourth-generation dendrimer with attached oligomeric terminal segments // Journal of Physical Chemistry B, 2014, V. 118, No. 51, P. 14961–14971.
    https://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/jp509151w

Экспериментальные и теоретические исследования пептидных дендримеров

  • N.N. Sheveleva, D. A.Markelov, M. A. Vovk, I. I. Tarasenko, M. E. Mikhailova, M.Y. Ilyash, I.M. Neelov, E. Lähderanta / Stable Deuterium Labeling of Histidine-Rich Lysine-Based Dendrimers // Molecules, 2019, V. 24, N. 2481.
    https://www.mdpi.com/1420-3049/24/13/2481
  • S.E. Mikhtaniuk, V.V. Bezrodnyi, O.V. Shavykin,; I.M. Neelov, N.N. Sheveleva, A.V. Penkova, D.A. Markelov / Comparison of Structure and Local Dynamics of Two Peptide Dendrimers with the Same Backbone but with Different Side Groups in Their Spacers // Polymers, 2020, V. 12, No. 1657.
    https://www.mdpi.com/2073-4360/12/8/1657
  • V.V. Bezrodnyi, O.V. Shavykin , S.E. Mikhtaniuk, I.M. Neelov, N.N. Sheveleva, D.A. Markelov / Why the orientational mobility in arginine and lysine spacers of peptide dendrimers designed for gene delivery is different? // Int. J. Mol. Sci., 2020, 21, 9749.
    https://www.mdpi.com/1422-0067/21/24/9749
  • V.V. Bezrodnyi, S. E. Mikhtaniuk, O. V. Shavykin, I. M. Neelov, N. N. Sheveleva, D. A. Markelov / Size and structure of empty and filled nanocontainer based on peptide dendrimer with histidine spacers at different pH // Molecules, 2021, 26, 6552.
    https://www.mdpi.com/1420-3049/26/21/6552

 

Сотрудники, принимающие участие в этих исследованиях

Шевелева Надежда Николаевна, ассистент, к.т.н.

Figure3 Sheveleva 

Хуснутдинова Наира Рустемовна, аспирант

 Figure4 Naira

 

Исследования композитных полимерных материалов  для создания новых мембранных материалов

В процессе первапорации перенос вещества через непористую мембрану осуществляется от фазы с высокой концентрацией вещества к фазе с более низкой концентрацией, т.е. движущей силой является разность химических потенциалов. Разделение низкомолекулярных жидких веществ происходит путем их диффузии через непористые мембраны. Многие фундаментальные аспекты теории диффузионного разделения находятся пока в стадии разработки. Определенные успехи достигнуты в моделях, описывающих механизм транспорта, среди которых, безусловно, признанным является механизм «растворение-диффузия».

В процессе первапорации происходит разделение жидких смесей за счет их селективного испарения через непористую полупроницаемую мембрану. В вакуумном режиме первапорации движущей силой является градиент давления. Схема первапорационной установки представлена на Рисунке.

 

 Figure5
Рисунок. Схема первапорационной установки.

 

В нашей группе проводится исследование свойств новых композитных мембран  с помощью молекулярно-динамическое моделирования композитных систем“полимер+наночастицы”, в том числе при добавлении молекул жидкостей, разделяемых в процессе первопарации.

В качестве полимера используются материалы, которые показали свою эффективность для разделения жидкостей в процессе первапорации. Новизной наших исследований является добавление новых наночастиц, позволяющих улучшить свойства мембран. За последнее время нами были исследованы системы с добавлением:

- металл-органических каркасных структур (по-английски metal-organic framework или MOF (см. https://en.wikipedia.org/wiki/Metal%E2%80%93organic_framework))

 Figure6
Рисунок. Ячейка моделирования композитной системы, содержащей одну частицей MOF и 73 цепи  полифениленизофталамида. Атомы MOF отмечены сферами Ван-дер-Ваальса. Атомы полимера представлены схематично.

 

- наночастиц диоксида титана (например, см. https://en.wikipedia.org/wiki/Titanium_dioxide)

 Figure7
Рисунок. Ячейка моделирования композитной системы, содержащей одну наночастицу [TiO2] и 100 цепочек полиакрилонитрила c добавлением молекул воды (цветовая маркировка: желтый – Ti, темно-красный цвет — O из TiO2, красный цвет — O из воды, белый цвет — H из воды, атомы полимера представлены схематично)

 

Исследование композитных систем позволило подтвердить экспериментальные данные и объяснить причины эффективности  новых материалов для процесса первапорации.  Работа проводится в тесном сотрудничестве с научной группой А.В. Пеньковой (http://chem.spbu.ru/learning/studyoffice/237-scientific-activities/research-groups/2060-nauchnaya-gruppa-professora-a-v-penkovoj.html) на Химическом факультете СПбГУ.

 

Последние публикации по моделированию композитных материалов

  • A.V. Penkova, A.I. Kuzminova, M.E. Dmitrenko, V.A. Surkova, V.P. Liamin, D.A. Markelov, A.V. Komolkin, D.Y. Poloneeva, A.V. Laptenkova, A.A. Selyutin, A.S. Mazur, A.V. Emeline, S.Thomas, S.S. Ermakov / Novel pervaporation mixed matrix membranes based on polyphenylene isophtalamide modified by metal–organic framework UiO-66(NH2)-EDTA for highly efficient methanol isolation // Sep. Purif. Technol., 2021, 263, 118370
    https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S1383586621000721
  • M. Dmitrenko, A. Kuzminova, A. Zolotarev, D. Markelov, A. Komolkin, E. Loginova, T. Plisko, K. Burts, A. Bildyukevich, A. Penkov / Modification strategies of polyacrylonitrile ultrafiltration membrane using TiO2 for enhanced antifouling performance in water treatment // Sep. Purif. Technol.,  2022, 286, 120500
    https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S1383586622000600

 

Сотрудники, принимающие участие в этих исследованиях

Комолкин Андрей Владимирович, к.ф.-м.н, доцент

Figure8 Komolkin 

Базайкин Владимир, студент

 

 

Сотрудничество с российскими и зарубежными группами

Зарубежные  коллабрации

- Лаппеенрантский технологический университет (Лаппеенранта, Финляндия). Молекулярно-динамическое моделирования дендримеров с использованием кластера финской академии наук (входит в топ-10), экспериментальные исследования дендримеров.

- Лаборатория теоретической физики конденсированной материи, Сорбоннский университет, CNRS, (Париж, Франция). Развитие теории ориентационной подвижности дендримерных макромолекул, молекулярно-динамическое моделирование реологических свойств расплавов дендримеров

- Институт теории полимеров при Институте полимерных исследований им. Лейбница (Дрезден, Германия). Квантово-химические расчеты и молекулярно-динамическое моделирование дендримеров с азобензольными концевыми группами

 

Российские коллаборации 

Химический факультет МГУ (Москва)

ИТМО (СПб)

Институт высокомолекулярных соединений РАН (СПб)

Институт химической физики (Москва)

Химический факультет СПбГУ (СПб)

 

Публикационная активность и цитируемость

За последние 5 лет (2017-2021гг) опубликовано 23 статьи в научных журналах. Большинство статей опубликовано в журналах первого квартиля (Q1)
Figure8

 

Научные работы (статьи) довольно активно цитируются, что указывает на актуальность проводимых научных исследований
Figure9

 

Научные конференции

Коллектив группы активно участвует в российский и международных конференция где докладываются и апробируются научные результаты группы. 

Проф. Маркелов является председателем оргкомитета международной школы конференции  “Magnetic resonance and its applications. Spinus” (https://spinus.spb.ru/)

 

Гранты

Большая научная активность позволяет руководителю и участникам группы выигрывать гранты (как для группы, так и индивидуальные) и привлекать внешнее финансирование для командировок (стажировок).