English 
Русский 
Уважаемые студенты и преподаватели кафедры!
19 октября (среда) в 17.00 состоится семинар кафедры. Тема:
Дестабилизация структуры и агрегация белков при окислительном стрессе: изучение РНК-распознающего домена RRM2 нейропатологического белка TDP-43
Докладчик: Рабдано С.О., аспирант кафедры ЯФМИ, стажер-исследователь лаборатории биомолекулярного ЯМР.
Место проведения: НИИ Физики, корпус «И», 1 этаж помещения профиля НСФ кафедры ЯФМИ, Лекционный Холл.
Аннотация:
Мы исследовали поведение второго РНК-распознающего домена (RRM2) нейропатологического белка TDP-43 под влиянием окислительного стресса моделированного in vitro. Для этого мы использовали специальным образом адаптированную версию ЯМР экспериментов по H/D обмену, эксперименты по ЯМР релаксации 15N, эксперименты ДРС в сочетании с HSQC спектроскопией, контролируемый протеолиз, гель-электрофорез и сайт-направленный мутагенез. В окислительных условиях RRM2 формирует частицы агрегатов с характерным размером около 18 единиц мономера. Белковые цепи внутри агрегатов связаны дисульфидными мостиками и дестабилизированы (частично разупорядочены). Два механизма, вероятно, имеют место в формировании агрегатов. В первом сценарии формирование случайных дисульфид-связанных димеров вызывает частичное разворачивание доменов RRM2, что приводит к агрегации. Во втором сценарии домены RRM2 сохраняют структурную целостность при формировании дисульфид-связанных димеров, однако претерпевают «разворачивание при связывании» ("unfolding upon binding"), когда димеры ассоциируют друг с другом. При устранении окислительного воздействия, когда образец помещается в восстанавливающие условия, равновесие смещается в сторону мономерной формы RRM2, тем не менее, значительная часть белка остается изолированной в частицах агрегатов. Вследствие структурной неупорядоченности белка в агрегатах, эти образцы чрезвычайно восприимчивы к протеолизу. Складывающаяся картина представляет подробное описание того, как окислительный стресс способствует нейродегенеративным заболеваниям, которые сопровождаются разворачиванием белков, агрегацией и протеолизом, как различными аспектами процесса.